Микропористые мембраны фильтрации обеспечивают физический барьер проходу частиц и микроорганизмов и имеют абсолютные оценки до 0.1 микрон; некоторые системы ELGA также соединяются "ультра - микро фильтры" с оценкой в 0.05 микронов. Самые «сырые» воды содержат коллоиды, у которых есть небольшой отрицательный заряд (измеренный потенциалом Дзэты). Работа фильтра может быть увеличена при использовании микро фильтров, которые включают измененную поверхность, которая привлечет и сохранит эти естественно происходящие коллоиды, которые вообще намного меньше, чем размеры поры в мембране. Микрофильтры с абсолютным размером поры в 0.2 микрона широко используются в системах очистки воды. Они «заманивают» загрязнители в ловушку, включая углеродистые частицы с органических адсорбционных патронов, частицы смолы с патронов ионного обмена и бактерий.

Субмикронный фильтр должен быть приспособлен фармацевтом так, чтобы он был последним фильтром, через который проходит вода прежде, чем она пойдет в использование. Альтернативный подход должен включать субмикрон и петлю рециркуляции, чтобы непрерывно удалять бактерии из очищенной воды. Фильтры субмикрона должны также быть помещены в критических пунктах использования для абсолютной защиты, и чтобы предотвратить новое загрязнение системы бактериями. Микропористые мембраны, как вообще полагают, обязательны в водной системе очистки, если они не заменены ультрафильтром.